Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TOR4AQ9NXH8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOR4AQ9NXH8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOR4AQ9NXH8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TOR4AQ9NXH8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms