Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCIQ9NVI1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCIQ9NVI1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms