Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC3Q9NUD5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms