Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOPORSQ9NS56 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms