Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTBN5Q9NRC6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms