Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCDH12Q9NPG4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms