Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCNB1IP1Q9NPC3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms