Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRHQ9HD43 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRHQ9HD43 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms