Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAP3Q9H6T3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms