Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B8

DPEP3, Dipeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPEP3Q9H4B8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DPEP3Q9H4B8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DPEP3Q9H4B8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPEP3Q9H4B8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms