Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF39Q9H2S5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF39Q9H2S5 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms