Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG10Q9H0Y0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG10Q9H0Y0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms