Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP44Q9H0E7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP44Q9H0E7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP44Q9H0E7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP44Q9H0E7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP44Q9H0E7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP44Q9H0E7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms