Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM6Q9C030 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms