Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC13A1Q9BZW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms