Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRTQ9BXP5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms