Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms