Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms