Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKNK1Q9BUB5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms