Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms