Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG101Q9BSB4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms