Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK1Q9BRS2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms