Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGIP1Q9BQI5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGIP1Q9BQI5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms