Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPGQ9BPX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPGQ9BPX3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms