Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms