Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRG3Q99928 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRG3Q99928 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms