Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS8Q99627 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms