Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMG1Q96Q15 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMG1Q96Q15 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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