Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP4Q96PP9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP4Q96PP9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP4Q96PP9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms