Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms