Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC43Q96MW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC43Q96MW1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms