Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SAMD8Q96LT4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SAMD8Q96LT4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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SAMD8Q96LT4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SAMD8Q96LT4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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SAMD8Q96LT4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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