Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EP400Q96L91 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms