Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS2Q96L46 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS2Q96L46 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS2Q96L46 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms