Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDLIM2Q96JY6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms