Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDHR1Q96JP9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms