Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms