Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHDQ96IW2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms