Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A3Q96HJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms