Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms