Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39LQ96EH5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms