Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC11Q96DB2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms