Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUNDC1Q96C34 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC1Q96C34 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms