Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF428Q96B54 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF428Q96B54 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms