Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAMP4Q969E2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms