Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT35Q92764 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT35Q92764 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms