Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4BQ92750 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4BQ92750 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms