Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNKSR2Q8WXI2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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