Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMO7Q8WWI1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMO7Q8WWI1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.1 ms