Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG1Q8WTW3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COG1Q8WTW3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms